Clq, фиксированный относительно стабильными по структуре фрагментами молекулы иммуноглобулина Fc на поверхности объекта фагоцитоза, объединяется с двумя другими элементами системы комплемента, ее субъединицами ClrnClsB молекулярный комплекс, стабилизируемый ионами кальция. В составе данного молекулярного комплекса субъединица Cls приобретает свойство протеолитического фермента. Протеаза Cls расщепляет фракцию системы комплемента С4. В результате расщепления фракции системы комплемента С4 образуются два ее фрагмента, больший С4Ь, обладающий свойствами протеолитического фермента, и меньший С4а. Фракция системы комплемента С2 образует комплекс с С4Ь. Этот молекулярный комплекс представляет собой субстрат для Cls. Под влиянием Cls как энзима из данного субстрата образуется молекулярный комплекс С4Ь2Ь, который обладает функциями специфичной СЗ-конвертазы.
В результате расщепления фракции СЗ высвобождается ее субъединица СЗЬ. Молекула СЗЬ, соединяясь с комплексом С4Ь2Ь, превращает его в фермент, расщепляющий фракцию С5. При альтернативном пути активации комплемента ферментом, расщепляющим фракцию системы комплемента С5, является молекулярный комплекс СЗЬВЬ. В дальнейшем активация системы комплемента происходит одинаково как по классическому, так и по альтернативному пути. Механизм блокирования активации системы комплемента по классическому пути состоит в деградации комплекса С4Ь2Ь под влиянием С4-связывающего белка или вследствие взаимодействия с СЗЬ-рецепторами клеточной поверхности в присутствии фактора I.
Фракция системы комплемента С5 расщепляется на короткий пептид С5а и большую часть С5, С5Ь. СЗЬ фиксируется на объекте фагоцитоза и последовательно связывает фракции системы комплемента С6, С1 и С8. Образованный молекулярный комплекс способствует правильной ориентации одной или более молекул последней фракции системы комплемента С9. Это обуславливает развертывание молекул С9 и их проникновение в липидный бислой наружной мембраны атакуемых микроорганизма или чужеродной клетки. Полимеризация молекул С9 внутри наружной мембраны образует в ней кольцеобразный «мембраноатакующий комплекс», формирующий канал, по которому незатрудненно в соответствии с градиентами осмотических концентраций мигрируют осмоли и вода. Высокое коллоидно-осмотическое давление в клетке приводит к поступлению